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分子プロファイリング支援活動

班長 清宮啓之(公益財団法人がん研究会)

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活動内容

本活動は、ケミカルバイオロジーおよびバイオインフォマティクスを動員した分子プロファイリング・分子探索基盤の提供により、優れた小分子バイオプローブの創出、生命現象に関与する機能分子の探索を支援します。これらにより、動物・個体レベルの支援のみではカバーしきれない、小分子〜細胞レベルの研究を分野横断的に推進し、我が国の生命科学の飛躍的進展に貢献します。

Ⅰ. 分子プロファイリング支援|化合物が有する生理活性の解明・検証

支援対象者の化合物について、細胞の増殖と形態、遺伝子・タンパク質発現に対する影響を評価するとともに、統合データベースを用いたバイオインフォマティクス解析により、その作用点を予測します。活用例として、支援対象者が単離もしくは創製した新規化合物の未知の生理活性の解明、小分子バイオプローブとしての特異性やオフターゲット効果の検証などに有効です。

Ⅱ. 分子探索支援|生命現象に影響を与える化合物・遺伝子の同定

標的が明らかな化合物(キナーゼ阻害剤など)および小分子干渉RNAをライブラリー化し、支援対象者に配付します。これらは、支援対象者が追究する生命現象の制御分子スクリーニングや、新規スクリーニング系のパイロット試験など、さまざまな用途に利用できます。また、バーコードshRNAライブラリーを用いた機能ゲノミクス探索により、生命現象の制御遺伝子の同定を支援します。

III. 本支援活動の構成メンバー

メンバー 所属 役割分担
清宮 啓之 公益財団法人がん研究会 がん化学療法センター分子生物治療研究部・部長 分子プロファイリング支援活動の総括、トランスクリプトーム解析による分子プロファイリング
長田 裕之 国立研究開発法人理化学研究所・環境資源科学研究センター・副センター長 プロテオーム解析による分子プロファイリング
旦 慎吾 公益財団法人がん研究会 がん化学療法センター分子薬理部・副部長 細胞パネルの増殖解析による分子プロファイリング
井本 正哉 慶應義塾大学・理工学部・教授 細胞表現型解析による分子プロファイリング
川田 学 公益財団法人微生物化学研究会・微生物化学研究所 第1生物活性研究部・部長 化合物ライブラリーの構築と配付
田原 栄俊 広島大学・医歯薬保健学研究院・教授 RNA干渉キットの構築と配付
吉田 稔 国立研究開発法人理化学研究所・環境資源科学研究センター・グループディレクター バーコードshRNAシークエンス技術による分子探索
松浦 正明 帝京大学・大学院公衆衛生学研究科・教授 包括的データベースの構築とin silico解析
牛嶋 大 公益財団法人がん研究会 ゲノムセンター・研究員 包括的データベースの構築とin silico解析
連携研究支援者
矢守 隆夫 独立行政法人医薬品医療機器総合機構・審査センター長 分子プロファイリング支援活動の総括補佐
冨田 章弘 公益財団法人がん研究会 がん化学療法センターゲノム研究部・部長 網羅的遺伝子発現データの解析
室井 誠 国立研究開発法人理化学研究所・環境資源科学研究センター・専任研究員 プロテオーム解析を用いた多変量解析

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